蛋白研究经典案例解读 | 蛋白质组专题

蛋白质组学是以蛋白质组为研究对象，研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学。运用蛋白质组学技术可以大规模研究蛋白质的特征，包括蛋白质的表达水平，翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢等过程的整体而全面的认识。

本期专题将围绕蛋白质组学技术简介及应用场景展开，主要介绍蛋白相对定量技术、绝对定量技术以及蛋白修饰分析的原理及技术优势，蛋白组学常见研究模式，蛋白样本准备注意事项以及经典案例解读等。

今天内容主要为蛋白组学经典案例解读。

一起开启学习模式吧~

蛋白新型标志物挖掘案例

热休克蛋白47作为结直肠癌淋巴结转移的预测标志物

论文标题：Proteomics analysis of differential protein expression identifies heat shock protein 47 as a predictive marker for lymph node metastasis in patients with colorectal cancer

刊登日期：2016年12月

发表杂志：International Journal of Cancer

影响因子：6.5

研究机构：日本三重大学医学院

蛋白组和其他组学联合分析案例

由于蛋白质处于整个中心法则的中间位置，上有DNA和RNA，下有小分子代谢物，所以常常与基因组、转录组和代谢组结合起来研究，特别对于某些相对小众的研究主题，结合蛋白组学和转录组学可以鉴定mRNA和蛋白表达异常，结合基因组学和蛋白组学从DNA和蛋白突变角度展开，结合代谢组学可以从代谢角度展开研究。所以，本身组学的研究就能让我们更全面的了解疾病的发生发展过程。

客户案例：转录组及蛋白质组学技术鉴定腐食酪螨过敏原

论文标题：Transcriptomic/proteomic identification of allergens in the mite Tyrophagus putrescentiae

刊登日期：2016年11月

发表杂志：Allergy（过敏学医学一区顶级期刊）

研究机构：盐城市第三人民医院/无锡市人民医院崔玉宝课题组

1. 转录组+iTRAQ鉴定腐食酪螨过敏原，qPCR验证；研究对筛选出的过敏原序列进行基因克隆，并置于细菌原核表达，从中得到的重组蛋白经纯化后，检测其与腐食酪螨过敏病人血清中IgE的结合情况，并利用Western blotting对二者结合特性进行测定。

2.这些分析确定了三个以前未鉴定的过敏原，分别为Tyr p28、Tyr p35及Tyr p36，并已被WHO/ IUIS过敏原命名小组委员会正式命名。

3.重组蛋白rTyr p 28，rTyr p 35及rTyr p 36与血清中IgE的结合率分别为47.1％，82.4％及70.6％。

大肠癌组织样本的蛋白质组学和转录组学整合研究

论文标题：Transcriptomics and proteomics show that selenium affects inflammation, cytoskeleton, and cancer pathways in human rectal biopsies

刊登日期：2016年08月

发表杂志：FASEB Journal

影响因子：5.5

研究机构：纽卡斯尔大学医学院

文章结合了转录组学和蛋白组学检测手段对正常组，Se最佳摄取组与亚摄取量组结直肠癌活检样本中的RNA和蛋白表达进行检测，结果发现Se摄取影响到了炎症、细胞骨架重构和NFκB信号通路相关蛋白表达，并参与到细胞增殖、凋亡等生物学过程。

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